El tratamiento de la trombosis portal depende de múltiples factores, como si la trombosis es reciente o crónica, si existe cirrosis u otra enfermedad hepática, la extensión del trombo y el riesgo de nuevos episodios trombóticos.
En la mayoría de los pacientes el tratamiento principal son los anticoagulantes, medicamentos que ayudan a evitar que el trombo crezca y favorecen la reapertura de la vena. Actualmente existen diferentes opciones de tratamiento anticoagulante, incluyendo heparina, antagonistas de la vitamina K y anticoagulantes orales directos como rivaroxaban, apixaban, edoxaban o dabigatran. El tratamiento debe individualizarse siempre según las características de cada paciente y requiere seguimiento médico periódico.
En la trombosis portal reciente, iniciar anticoagulación precoz aumenta claramente la probabilidad de recanalización.
En algunos casos complejos puede ser necesario recurrir a técnicas de radiología intervencionista. Estos procedimientos permiten actuar directamente sobre el trombo mediante catéteres introducidos a través de los vasos sanguíneos. Dependiendo de cada situación, pueden realizarse trombólisis (tratamientos para disolver el coágulo), angioplastias, colocación de stents o procedimientos como el TIPS, que ayuda a disminuir la presión portal y mejorar el flujo sanguíneo. Estas técnicas suelen reservarse para pacientes seleccionados, especialmente cuando existe progresión de la trombosis, hipertensión portal importante o falta de respuesta al tratamiento convencional. Estos tratamientos deben hacerse en centros altamente especializados.
En las formas agudas más graves, cuando la trombosis afecta al riego sanguíneo del intestino y se produce una isquemia intestinal, puede ser necesaria una cirugía urgente. En algunos casos es preciso extirpar segmentos del intestino que hayan sufrido daño irreversible por falta de irrigación sanguínea. Aunque esta situación es poco frecuente, representa una de las complicaciones más graves de la trombosis portal aguda y requiere tratamiento urgente en centros especializados.